第675章 我想这需要一个解释

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物博士苦笑着比喻。

面对挑战，陆时羡没有丝毫犹豫。

他立即在研究院内成立了“神威平台紧急攻关小组”，由赵栋梁负责，并专程从江南计算技术研究所请来了几位对“神威”架构有深入理解的专家进行联合攻关。

接下来的几周，计算中心的灯光几乎彻夜长明。

攻关小组面临的首要任务，是软件生态的移植与适配。

这并非简单的重新编译，而是需要对代码进行深度的重构和优化，以充分利用“神威”处理器上大量的运算核心和特定的指令集。

“我们必须把一个大任务，分解成成千上万个能在这260个核心上高效并行跑起来的小任务，”赵栋梁向团队成员解释：“这涉及到算法层面的重新设计，而不仅仅是在代码里加几条并行指令那么简单。”

他们选择了几个最核心、计算最密集的应用作为突破口：

分子动力学模拟的重构：传统的模拟软件在“神威”上效率极低。

团队与计算所的专家合作，针对SFR-1与GPCR、SNARE可能形成的复合物体系，重写了关键的计算内核，特别是用于计算范德华力和静电相互作用力的短程和长程作用力计算部分。

他们利用“神威”的众核优势，将空间分解算法发挥到极致，使得模拟数百万原子体系的速度提升了数十倍。

艾里森留下的动态网络模型是寻找枢纽蛋白的关键理论工具，但其原本的并行效率不高。

团队对模型进行了彻底的剖析，将网络中节点状态的更新、相互作用的计算等任务，极其精细地划分并映射到“神威”的数千个核心上，实现了近乎线性的加速比。

这使得他们能够处理比之前庞大复杂十倍的蛋白质相互作用网络，并进行更长时间尺度的演化模拟。

埃琳娜团队积累的冷冻电镜单颗粒数据高达数百TB，其三维重构和异质性分析是巨大的计算负担。

团队将基于Relion等软

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