第676章 努力的回报

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要优化的计算伪影，还是它真的提示了一个我们忽略的生物学关键点？”

辛勤的汗水终于换来了回报。

当经过深度优化的程序开始在“神威”上稳定运行，海量的计算任务以前所未有的速度完成时，惊喜开始不断涌现。

第一个发现是SFR-1的“双面人格”。

在之前基于“鸿蒙”的、时间尺度较短的模拟中，SFR-1被认为主要与激活状态的GPCR相互作用。

但在“神威”上进行的、长达微秒级的高精度分子动力学模拟中，团队惊讶地发现，SFR-1的某个特定结构域，在特定的膜脂环境和小分子配体，可能是细胞内未知的第二信使存在的条件下，会表现出一种奇特的“双面性”。

即它既能与激活态的GPCR结合，也能以一种不同的构象，与某些处于“预备”或“失活”状态的GPCR发生弱相互作用。

“这暗示SFR-1可能不仅仅是一个被动的‘连接器’，它本身可能参与了对GPCR状态的‘感知’和‘选择’，就像一个智能开关，能判断哪些信号值得放大和传递。”罗伯特教授看到这个结果时，激动地指着屏幕上的动态轨迹说道。

第二个发现是“孤儿domain”的潜在功能。

埃琳娜团队提供的更高分辨率的冷冻电镜结构，结合“神威”上运行的、更复杂的柔性拟合和分子动力学模拟，为那个功能未知的“孤儿domain”提供了全新的线索。

模拟显示，这个domain并非刚性结构，而是一个高度动态的、富含带电氨基酸的“触手”。在模拟中，它表现出与多种不同SNARE蛋白组分相互作用的倾向，但其结合强度和特异性，似乎受到SFR-1其他区域构象的变构调控。

当SFR-1与GPCR结合后，这个‘触手’的构象熵明显降低了，变得更加有序，这很可能增强了它与特定SNARE蛋白的结合能力！
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