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第682章 惊人的共识
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收敛性分析数据如RMSD随时间变化、关键相互作用距离的分布等,以证明所观察到的构象变化是体系固有的性质,而非采样不足导致的假象。”
对于预测“影子网络”的数据模型,他提出了最尖锐的问题:“模型的训练数据集是什么?其架构和超参数选择依据为何?如何避免过拟合?更重要的是,模型做出的预测,哪些是基于数据中真实存在的模式,哪些可能是模型自身偏差产生的?”
他要求作者提供模型的可解释性分析,例如通过扰动输入数据,观察哪些特征对预测“影子网络”成员最关键,从而为这个发现的“网络”提供生物学上的合理性支撑。
法森特的审稿意见极其技术化,充满了公式和术语。
他的认可,是这篇论文计算部分可信度的“通行证”。
他的质疑,也同样直指交叉学科研究中最容易被传统生物学家诟病的软肋。
......
米国,加州。
布莱克本教授正待在家里,打开了书房里的台灯。
她不习惯在电脑上审稿,而是喜欢戴着眼镜将论文全文打印下来,一个字一个字细细审阅。
她快速把握了论文的核心脉络,并将其置于整个生物学研究的大图景中进行考量,展现出一种纵观全局的智慧。
她敏锐地注意到,论文提出的“变构开关”、“精准识别”与“分布式冗余”三大机制,共同构筑了一个逻辑严密、且符合进化论思想的“智能”系统。
“这项工作不仅提供了新的部件,更描绘了一幅关于细胞内部组织协调性的、更具整体性的新图景,这在当今碎片化的研究中尤为珍贵。”她在笔记中写道。
她认同拉斐尔斯关于补充生化实验的重要性,但也指出,在如此一篇开创性的论文中,要求每一个计算预测都立刻有完美的实验验证是不现实的,这会极大地延缓重大发现的传播。
她更倾向于建议作者在表述上更加精
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